西表石垣国立公园的红树林和礁石吸引了大冠鹫、黄缘闭壳龟和珊瑚礁鬼蝠鲼等生物来此栖居。
西表石垣国立公园拥有日本最大的红树林以及北半球规模最大的蓝珊瑚群落。公园岛屿上的沿海森林植被多样，有黄槿、露兜树及当地特有的八重山棕榈等。
这些自然环境吸引了各种迷人的生物栖息在此，其中包括大冠鹫、黄缘闭壳龟和珊瑚礁鬼蝠𫚉。西表山猫等物种只栖息于这座公园的岛屿上，岸上石龙子则仅见于公园境内的八重山群岛和公园境外的与那国岛。
植物
红树林
红树林生长于淡水与海水混合的区域，为亚热带所独有。西表石垣国立公园的红树林主要由海榄雌和红茄苳组成。西表岛的仲间川拥有日本规模最大的红树林。
红树林
动物
珊瑚礁鬼蝠鲼
珊瑚礁鬼蝠鲼（学名：Manta alfredi）是全世界最大的鳐鱼品种之一。它们在世界各地的热带与亚热带海域活动。在八重山群岛周围的海域经常能发现其踪影，特别是川平湾，这里的“鬼蝠鲼清洁站 (Manta Scramble)”是蝠鲼的聚集之地。
珊瑚礁鬼蝠鲼
西表山猫
西表山猫（学名：Prionailurus bengalensis iriomotensis）在 1965 年方为人所知，是一种仅栖居在西表岛上的石虎亚种。如今岛上仅剩约 100 只西表山猫，因此它们属于极危物种。
西表山猫