在日光国立公园的那须和盐原地区，景观会随着海拔的升高而不断变化，日本山毛榉及橡树等落叶阔叶树生长在海拔较低的地区，再往上则是冷杉及侧柏等针叶树。这片区域是日本髭羚、梅花鹿及亚洲黑熊等大型哺乳动物的栖息地，也是各种鱼类和两栖动物的家园。
在日光和鬼怒川地区海拔超过 1,600 米的地方，您可以观赏到针叶林和岳桦。在海拔超过 2,400 米的山脊和山峰处，您可以看到灌木状的高山带植被，从此处望去，周围的景色一览无余。鬼怒沼和战场之原等湿地上覆盖着羊胡子草，也有许多日本猕猴栖息在此。
植物
白根葵
白根葵（学名：Glaucidium palmatum）是日本特有物种，其名字里的“白根”(shirane) 源自日光白根山，因为那里曾有大量此种花卉。由于鹿的捕食和非法采挖，如今白根葵的数量已大幅减少。政府已制定持续的保护措施来保护这一物种。
白根葵
动物
日本猕猴
日本猕猴（学名：Macaca fuscata）的足迹遍布日光地区，但山区除外。日光市制定了日本首部禁止喂食日本猕猴的法令，并提醒人们猕猴有偷取游客背包的习惯，从而大大减少了这类问题的发生。
日本猕猴
梅花鹿
雄性梅花鹿（学名：Cervus nippon）有着巨大的鹿角。由于数量急剧增加，它们已成为森林植被遭到严重破坏的主要原因。在奥日光经常可以发现它们的身影。
梅花鹿
亚洲黑熊
亚洲黑熊（学名：Ursus thibetanus japonicus）的日文名称为“tsukinowaguma”，意为“月牙熊”，因为它们的胸部有独特的白色月牙形斑纹。亚洲黑熊是本州（日本本岛）体型最大的哺乳动物，经常出没于公园的森林中。
亚洲黑熊