尾濑国立公园的湿地是许多特有珍稀植物的家园，在这里可以观赏到日本白根葵、萱草及白毛羊胡子草等植物。公园的群山覆盖着日本山毛榉、大白时冷杉及岳桦。
公园也是许多哺乳动物的家园，亚洲黑熊、日本髭羚、日本白鼬及各种各样的鸟类与昆虫均栖息于此。
植物
萱草
大片的萱草（学名：Hemerocallis dumortiei）会在每年 7 月于尾濑之原及尾濑沼附近盛开。这种植物亮黄色的花朵通常只能存活一天。
萱草
尾濑萍蓬草
尾濑萍蓬草（学名：Nuphar pumilum var. ozeense）是日本特有的多年生水生植物。每年 7 月至 8 月，这种植物会在尾濑国立公园的池塘中绽放出黄色的小花，花朵的中间为红色。
尾濑萍蓬草
动物
日本白鼬
日本白鼬（学名：Mustela erminea nippon）属于鼬科，为肉食动物，栖居在海拔超过 1,200 米的亚高山地区。白鼬的毛色会从夏季的棕色逐渐变为冬季的白色，但下腹部终年都是白色。
日本白鼬
日本髭羚
日本髭羚（学名：Capricornis crispus）外形似鹿，但实际上它们与牛的亲缘关系更为接近。它们毛色各异，从灰黑色到米白色都有。这种独行动物是日本特有物种，已被指定为特别天然纪念物。
日本髭羚