動植物

瀨戶內海國家公園的海灘、潮埔和島嶼環境，孕育了豐富的海岸植物及海洋生物。沿海地區點綴著日本紅松及枹櫟，黃槿（黃色花瓣）與單葉蔓荊等開花植物也在此地生長。

園區的水域中還棲息著許多動物，例如三棘鱟與江豚。周防大島地區是全世界最大的日本汽孔珊瑚棲息地，此處也被指定為海洋公園。

植物

單葉蔓荊（學名：Vitex rotundifolia）是一種生長在沿海區域的常青灌木，其葉片構造具有耐寒特性，有助於抵抗沿海的強風和乾燥的環境。單葉蔓荊會在每年 7 月至 9 月期間開出藍紫色的花朵。到了 10 月，則會結出棕色的小果實，這種果實還可以當作草藥來使用。

小葉三葉杜鵑（學名：Rhododendron reticulatum）是一種落葉杜鵑，每年的 3 月至 4 月期間，都會在瀨戶內海國家公園內各個區域綻放出粉紫色的花朵。

日本汽孔珊瑚（學名：Alveopora japonica）是東亞溫帶水域特有的生物。這種珊瑚表面有觸手，外觀與海葵極為相似。周防大島地區擁有世界上數量最多的日本汽孔珊瑚。

江豚（學名：Neophocaena phocaenoides）是一種棲息在仙台灣、伊勢灣、及瀨戶內海的海豚。這種海豚的身長最大約為 2 公尺，體型通常比一般海豚來得小，牠們以魚類、蝦類、魷魚、烏賊和章魚為食。